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影響全自動(dòng)核酸純化儀提取效率的因素
更新時(shí)間:2021-09-24
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全自動(dòng)核酸純化儀
在核酸檢測中經(jīng)常用到,在核酸檢測實(shí)驗室拿到樣本之后,進(jìn)行核酸檢測時(shí),首先要做的就是使用全自動(dòng)核酸純化儀將樣本中的核酸提取出來(lái),提取出的核酸直接關(guān)系到后續的檢測,一般核酸提取的主要步驟分為四步:裂解、吸附、洗滌和洗脫,每一步出現問(wèn)題都會(huì )影響磁珠的提取效率。
一、樣本裂解是裂解細胞或病原體,釋放里面的核酸。影響裂解的主要因素有裂解液的成分及裂解的溫度和時(shí)間。
裂解液成分:對于一些難裂解的樣本,可以通過(guò)提高胍鹽濃度以及表面活性劑濃度來(lái)增強裂解液的裂解能力。
裂解溫度和時(shí)間:提高溫度和增加裂解時(shí)間可以讓細胞裂解更*,得到更多核酸,需要摸索合適的溫度和時(shí)間;溫度過(guò)高或時(shí)間過(guò)長(cháng),也有可能導致核酸斷裂或醇類(lèi)揮發(fā)導致的提取效率下降。
二、吸附是磁珠吸附核酸的能力,影響吸附能力的有磁珠的吸附能力以及結合緩沖液的結合能力。磁珠吸附能力受到磁珠比表面積以及修飾基團的密度影響??筛鶕?shí)際樣本選擇磁珠粒徑和修飾基團。
三、洗滌是去除DNA以外的RNA、蛋白質(zhì)等雜質(zhì)。關(guān)系到核酸的純度,磁棒的振蕩幅度和混合時(shí)間會(huì )影響洗滌效率。磁棒振蕩幅度太小或混合時(shí)間太短,有雜質(zhì)殘留在磁珠上會(huì )影響磁珠吸附核酸的能力。振蕩太劇烈或時(shí)間太長(cháng),會(huì )丟失部分核酸或造成核酸的斷裂、降解,得率下降。
四、洗脫是解離吸附在磁珠上的DNA,得到純度和濃度均很高的DNA,直接影響核酸得率,影響洗脫效率的因素有磁珠的干燥程度以及洗脫溫度和時(shí)間。磁珠未充分晾干,可能會(huì )有醇類(lèi)等雜質(zhì)殘留,影響后續PCR反應;磁珠過(guò)分干燥,核酸可能會(huì )干結在磁珠上,導致洗脫效率下降。適當提高洗脫溫度和時(shí)間,有利于核酸從磁珠上游離下來(lái),時(shí)間過(guò)長(cháng)或溫度過(guò)高,核酸有可能會(huì )降解,需要把握其中的平衡。
注意以上四點(diǎn),利用全自動(dòng)核酸純化儀即可完成核酸檢測試驗。
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